Depozit tematic pe microbiom

pagini

  • Întrebări
  • Bilete
  • Proiecte
  • Cercetare
  • Mijloace
  • Videoclipuri
  • Autori
  • Bibliografie

Joi, 8 februarie 2018

4. Se schimbă microbiota odată cu dieta sezonieră?

schimbați

Fig 1. Compozițiile comunității microbiene intestinale Hadza sunt ciclice și pot fi diferențiate în funcție de sezon.

(A) Compoziții individuale de microbiota intestinală Hadza în 2013-uscat târziu (n = 41, verde deschis), 2014-timpuriu-umed (n = 19, violet), 2014-târziu-umed (n = 58, violet deschis), Subsezonurile 2014-uscare timpurie (n = 30, albastru deschis) și 2014-uscare târzie (n = 40, verde închis) reprezentate pe un complot UnoFrac PCoA neponderat (panoul din stânga). Eșantioanele colectate în sezonul uscat sunt diferite de eșantioanele de sezon umed (P <3 × 10-15 și P <3-16, Wilcoxon), în timp ce eșantioanele din sezonul uscat sunt indistincte (P = 0,15, Wilcoxon) (panoul din dreapta)

(E) Analiza liniară discriminantă, o abordare de învățare supravegheată care utilizează o combinație liniară de caracteristici pentru a maximiza separarea clasei, separă cu succes subsecțiunile, cu excepția anotimpurilor secetoase. Lungimea și direcția săgeților indică scale normalizate pentru fiecare dintre caracteristici (OTU).

Prin urmare, datele Hadza arată atât îmbogățirea funcției pentru principalele componente ale dietei de-a lungul anotimpurilor, cât și conservarea funcției în timpul a două anotimpuri uscate și uscate. Folosim metabolomica nedirecționată, o abordare independentă de secvență, pentru a genera o „amprentă digitală” de înaltă dimensiune a funcționalității comunității (26). Aceste date s-au diferențiat perfect între anotimpuri folosind metode de învățare nesupravegheate (Figura S4D), dar nu au făcut diferența între cele două anotimpuri secetoase.


Ne-am întrebat cum au fost colectate profilurile noastre de microbiotă din cele 350 de probe de scaun Hadza comparativ cu alte populații tradiționale și industrializate. Am analizat date compoziționale pentru 18 populații din 16 țări derivate din 26 de cohorte folosind atribuții taxonomice (Tabelul S5). Cele 18 populații au fost separate de-a lungul primei coordonate principale corespunzătoare modernizării (figura 3 și figurile S1 și S6, A și B).
---